『パラサイト・イヴ2』は、プレイステーション用ソフトとして発売されたシネマティック・アドベンチャーゲーム。前作『【PS】パラサイト・イヴ』のジャンルはRPGだったが、本作ではアドベンチャーとなった。

前作の事件から3年後の西暦2000年が舞台。

1997年クリスマスイヴ、カーネギーホールで発生した集団人体発火事件を発端に、一週間に渡ってニューヨークを震わせた「マンハッタン封鎖事件」。
それは、数十億年もの太古から細胞に寄生し、人類と共に進化してきたミトコンドリアが突如覚醒し、意思を持って活動を始めた事に起因するものだった。
凄惨を極めた事件は、N.Y.市警のアヤ・ブレア刑事の活躍によって一応の解決をみたが、それは更なる惨劇のほんの始まりに過ぎなかった。
事件後もミトコンドリア関連事件を追い続けたアヤがその事実に気付いたのは、惨劇の記憶もようやく薄れつつあった2000年、9月。
肌寒い夏の終わりの日だった…。