『ゴールデンアイ ダーク・エージェント』のPlayStation 2版とゲームキューブ版は、基本的なゲーム内容やシナリオ構成は共通していますが、プラットフォーム固有の仕様や機能面においていくつかの差異が存在します。両機種ともにEA Los Angelesが開発を担当しており、FPSとしての基本設計は統一されていますが、操作性や周辺機能に違いが見られます。

PS2版では、オンライン対戦機能が搭載されており、最大16人によるネットワークプレイが可能でした。この機能はGC版には非対応であり、ローカル対戦のみとなっています。また、PS2版では「E.V.I.L. AI」と呼ばれる敵AIの挙動が強化されており、プレイヤーの行動に応じた感情的・知性的な反応が演出される構成が強調されています2。一方、GC版では操作設定に「クラシック」モードが用意されており、NINTENDO64版『ゴールデンアイ007』に近い操作感を再現することが可能です。

グラフィック面では、両機種ともに当時の水準に準じた描画性能を備えており、ステージ演出やキャラクターモデルに大きな差異はありません。ただし、GC版では一部のエフェクト処理やロード時間において若干の最適化が施されており、プレイ感に影響を与える場面も報告されています。また、PS2版ではボタン配置が洋ゲー仕様（×決定、○キャンセル）となっており、操作ミスが起こりやすいという指摘も見られます。

総じて、PS2版はオンライン機能とAI演出に重点を置いた構成であり、GC版はローカル対戦と操作性の柔軟性に優れた設計となっています。どちらも同一タイトルながら、プレイスタイルや環境に応じた選択が求められる構造です。