『ハイパーデュエル』は、戦闘機とロボット形態を自在に切り替えながら戦う、横スクロール型のSFシューティングゲーム。プレイヤーは「バスターギア」と呼ばれる変形機体を操り、テロ組織に奪われた試作機「ブラックエンジェル」の奪還または破壊を目指して戦闘に挑む。選択可能な機体は3種類で、それぞれ火力・機動性・耐久性に異なる特性を持ち、プレイスタイルに応じた選択が可能。

戦闘は即死制を採用しており、敵弾や障害物との接触が即ミスに繋がる緊張感の高い設計。ファイター形態では高速移動と広範囲ショットが可能で、アーマー形態では高火力かつ地形無視の接触が可能となる。2つの形態を状況に応じて切り替えることで、ステージ攻略の幅が広がる。さらに、ボマーショットによる強力な攻撃や、トレーサー・ガンナーといったオプションユニットの活用が戦術に深みを与える。

ステージ構成は全8面で、各面にボスが配置されており、演出面ではコロニー突入から地表への落下、最終決戦に至るまで一貫したSFドラマが展開される。特に4面の「COSMO BABYLON」など、九十九百太郎氏によるBGMは熱量の高い演出を支えており、プレイヤーの没入感を高める要素となっている。

セガサターン版では、アーケードモードに加えてグラフィックや音楽を一新した「サターンモード」が搭載されており、アーマー形態時のショット角度固定機能など操作性の向上が図られている。出荷数が少なく、現在では高額で取引されるプレミアソフトとしても知られている。