『ネコ・トモ』のニンテンドー3DS版は、2018年11月21日にバンダイナムコエンターテインメントより発売された、言葉を話す2匹のネコと暮らす“ほんわか家族ができちゃうゲーム”です。プレイヤーは「ネココ」と「トモモ」と名付けられたネコたちと一緒に生活し、会話や着せ替え、模様替え、釣り、ガーデニングなどを通じて絆を深めていきます。

3DS版では、合成音声によるフルボイスでネコたちがプレイヤーの名前や教えた言葉を話す仕様が採用されており、日々の会話を通じて“家族”のような関係が築かれていきます。Switch版と異なり、3D立体視には非対応ですが、Newニンテンドー3DSにも対応しています。また、後に発売された『スマイルましまし』へのアップデートには非対応ですが、名前などの一部データは引き継ぎ可能です。