『CAPCOM VS. SNK ミレニアムファイト2000』のドリームキャスト版は、アーケード版をベースに移植された家庭用タイトルであり、NAOMI基板との互換性を活かした高品質な2D対戦格闘ゲームとなっています。本作は、カプコンとSNKの人気キャラクターが一堂に会するクロスオーバー作品であり、CAPCOMグルーヴとSNKグルーヴの選択によって異なる戦闘スタイルが楽しめる仕様です。ドリームキャスト版では、アーケード版と同様に1レバー＋4ボタンの操作体系が採用されています。

ドリームキャスト版には、アーケード版にはない追加要素として「シークレットファクター」が導入されており、プレイを通じて獲得するVSポイントを使用して隠しキャラクターやステージ、エキストラカラーなどを解禁することが可能です。また、ビジュアルメモリを活用することで、アーケード筐体との連動機能も実現されており、家庭用で解禁した要素をアーケード版で使用することができる仕組みが搭載されています。

さらに、ドリームキャスト版では「ペアマッチモード」や「キャラクターレシオセレクト」などの独自モードも追加されており、プレイヤーの戦略性とやり込み要素が大幅に強化されています。隠しキャラクターの解禁には特定条件の達成が必要であり、モリガンやナコルル、豪鬼などの登場には複数のステップを踏む必要があります。